197351. lajstromszámú szabadalom • Eljárás genetikusan kódolható aminosavakból álló polipeptid előállítására

6 197351 7 nukleotid-kináz segítségével radioaktivan megjelöljük. Ennek a radioaktív mintának a teljes DNS-ben lévő komplementer DNS-szekvenciá­­hoz történő hibridizálása érdekében a keve­réket 24 órán keresztül 37 °C hőmérsékleten állni hagyjuk. Ezután a meg nem kötődött radioaktív DNS-t eltávolítjuk, és a szűrőt 37 °C hőmérsékleten ötször 30 percenként 200-200 ml hibridizáló közeggel mossuk és ezt kővetően autoradioagrafáljuk. 24 órás ex­pozíció után a hibridizációs jelek azt mutat­ják, hogy a gén egy 2,3 kb Pst I-fragmen­­sen helyezkedik el. Ezt a fragmenset egy preparativ agaróz-gélböl származó, ennek a fr'agmensnagyságnak megfelelő kivágás elekt­­roelúciójával nyerjük, amely agaróz-gélre a teljes, Pst I-vel emésztett DNS-t felvittük. Az eluált DNS-t a pUC 8 plazmid Pst I hasí­tási helyébe klónozzuk (50 jul reakciótérfogat, 0,5 Mg DNS, Maniatis, id. h. 289. oldal). Eze­ket a hibrid plazmidokat JM 103 jelű E. coli­­-ba transzformáljuk (Maniatis et al., id. h. 250. oldal) és szaporítjuk. Azokat a kiónokat, amelyek a keresett tendamistat-gén részletet hordozzák. (A) jelű radioaktiv DNS mint a felhasználásával telep-hibridizációval mutat­juk ki. Az Így kapott pKA I la, illetve lb hibridplazmidokat az l._a és 1. b ábra mu­tatja. A gén helyzetét az izolált 2,3 kg Pst I-fragmenssel és ennek szubfragmenseivel végzett további Southern-hibridizációkkal pontosan meghatározhatjuk (2. a, 2. b, 2. c ábrák). 2. példa A pIJ 102 plazmid szinguláris Pst I ha­sítási helyére [Kieser et al., Molecular Gene­ral Genetics 185, 223-238 (1982)] klónozzuk a S. tendae-ből származó 2,3 kb Pst I-frag­­menset. Az így kapott pAX la és lb hibrid­­plazmidok, amelyek a lényeges részlet orien­tációjában különböznek, S. lividans törzsekbe történő transzformáció után alkalmassá teszik ezen törzseket tendamistat termelésre. A 3. ábra mutatja a pAX la pl&zmidot. 3. példa A TK 24 jelű, kereskedelemben (John Innés Institute, Norwich, Anglia) kapható S. lividans törzset ismert módon protoplaszttá alakítjuk [Chater, K. F. etal., Current Topics in Microbiology and Immunology 96, 69-95 (1982)], és 1 MS PAX la jelű hibridplazmidot adunk 10® protoplaszthoz, 20% poli-(etilén­­-glikol) 6000 adagolása mellett. A transzfor­máit protoplasztot R2YE regenerációs közegen [Thompson és társai: Nature 286 (1980) 525. oldal] 30 °C hőmérsékleten 5 napig tenyészt­jük. A sejten kívüli amiláz inaktivátor, azaz a tendamistat képződésének kimutatását le­mezes vizsgálattal végezhetjük: A regenerált telepekre 5 ml 0,4-1,0 mg/ml pankreatint tar­talmazó vizes oldatot öntünk és 1 órán ke­resztül 37 °C-on inkubáljuk. Az oldatot ez­után leöntjük és 5 ml 2%-os keményítő agar­­i‘al helyettesitjük. A lemezekre 2 órás 37 °C hőmérsékleten történő inkubáció után 5 ml kálium-jodidos jódoldatot öntünk a szinelőhi­­vás céljából. Ha a telepeknek kék udvara képződik, akkor az azt mutatja, hogy a kió­nok tendamistatot szintetizálnak és választa­nak ki. Ellenőrzésként a tendamistatot terme­lő, jól spórázódó törzsekből a plazmid-DNS-t izolálhatjuk és feltérképezhetjük. Minden tendamistatot termelő törzsben előfordul a beültetett plazmid-DNS. 4. példa A 2. példában leírtak szerint járunk el, de pIJ 350 jelű plazmidot alkalmazunk, amely tiosztrepton-rezisztencia gént hordoz és ez a Streptomycesekben szelekciójelzöként műkö­dik. Ezzel az eljárással a pAX 350 a és b je­lű hibridplazmidokat kapjuk, amelyek a beik­tatott részlet orientációjában különböznek. A 4. ábra mutatja a pAX 350 a jelű plazmidot. A 3. példa szerinti transzformáció után minimál-közegre [Hopwood: Bacteriological Re­views 31 (1967) 373-403. oldal] szelektáljuk a rezisztens kiónokat 50 Mg/ml tiosztrepton je­lenlétében, és vagy közvetlenül a minimál­­-közegen, vagy nem szelektív R2YE-agarra történő átvitel után vizsgáljuk a tendamis­­tát-termelést. 5. példa A 2,3 kb Pst I-fragmenset tartalmazó hibrid plazmidok, amelyek a Streptomyce6- -replikonon kívül E. coli-replikont is tartal­maznak, mint .Shuttle "-vektorok egy sor előnnyel rendelkeznek. Ezek a hibrid plazmi­dok az E. coli-replikon és az E. coli-ban ha­tásos rezisztencia jelzők alapján ezekben a szervezetekben jól szaporíthatok. Izolálás és Streptomycesekbe - különösen S. lividans­­-ba - történő transzformáció után nagy a stabilitásuk. A Streptomycesekben hatásos szelekció jelzőik és a Streptomyces-replikon következtében ezekben a szervezetekben is jól szaporíthatok és exprimálhatók és tenda­mistatot választanak ki. A pAC 184 jelű plaz­midot a Sal I restrikciós enzimmel teljesen megemésztetjük és az enzimet fenol-klorofor­­mos extrakcióval eltávolitjuk. A kiálló 5' vé­geket ATP, CTP, GTP és TTP jelenlétében DNS-polimeráz enzim (Klenow-fragmens) se­gítségével feltöltjük. A tompa végekre (blunt ends) 16 °C hőmérsékleten történő ligáz-re­­akcióval (Maniatis et al., id.h. 243-244) az 5’ TCG AGC TGC AGC TCG A 3’ 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 * 65 5

Next

/
Oldalképek
Tartalom