193866. lajstromszámú szabadalom • Eljárás humán növekedési hormont kódoló DNS-szekvenciát tartalmazó plazmid E. coli baktérium előállítására

majd 4 percen át 25 C°-on, végül 30 percen át 0 C° hőmérsékleten folytatjuk az inkubációt. Ezután a megfelelő szelekciós körülmények között agar-lemezekre széletsztjük a sejte­ket. A rekombináns plazmidok kutatására, azaz a Hind III szakasz transzformációjának kimutatására 5 pg/ml tetraciklint haszná­lunk. Ily módon egy pAU—1 jelű rekombi­­nánst izolálunk. A pAU—1 rekombinánsból izolált 2 pg—5 pg DNS plazmid-készítmé­­nyek emésztünk Hsu 1 endonukleáz fölös­legével. Ezután végkoncentrációra számolva 10 mM EDTA—Na2—t és 10% (súlyszáza­lék) szacharózt adunk a reakcióelegyhez, majd 8% poliakrilamid gélen szétválasztjuk az elegyek Az elektroforézises vizsgálat szerint a DNS a 410 bázispárnak megfe­lelő helyen található. A fenti kísérletet pBR—322 plazmiddal megismételjük. Minden a fentiekben megadot­tak szerint végzünk, kivéve a rekombináns telepek szelekcióját, amit 20 pg/ml ampicillint tartalmazó lemezeken végzünk. 5. példa Ismertetjük a patkány növekedési hor­monjának megfelelő teljes strukturális gén­­-sorrendet tartalmazó DNS izolálását és tisz­títását, továbbá a patkány növekedési hor­monjának teljes strukturális génkészletét tar­talmazó DNS szinézisét és a patkány növeke­dési hormonjának génjét génkészletének részeként tartalmazó mikroorganizmus törzs előállítását. Abban az esetben, ha az izolált gének nem emberi eredetűek, úgy az Egyesült Ál­lamokban érvényes biztonsági korlátozások nem kívánják meg a cDNS olyan nagyfokú tisztaságban való izolálását, mint amikor em­beri eredetű cDNS-ekkel dolgozunk. Ily mó­don lehetséges az, hogy a patkány növeke­dési hormonjának strukturális génjét tartal­mazó cDNS-t elektroforetikus úton különítjük el: az elkülönített DNS a patkány növeke­dési hormonjának ismert aminosav-szekven­­ciája szerint körülbelül 800 bázispárt tar­talmaz. A patkány növekedési hormonját leíró mRNS forrásaként az American Type Culture Collection-ból beszerezhető GH—1 szubklóno­­zott és tenyésztett patkány sejteket hasz­náljuk (Tashjian és munkatársai, Endochrino­­logy, 82, 342, 1968). Ezekben a sejtekben közönséges körülmények között kivitelezett tenyésztéskor a növekedési hormont leíró mRNS az összes poli-A-t tartalmazó RNS-nek kicsinyrésze, 1—3 %-a. A növekedési hormon­nak megfelelő mRNS mennyiségét azonban tiroid hormonok és glukokortikoidok sziner­­gista hatásával oly módon növeltük, hogy az meghaladta a többi sejtben lévő mRNS mennyiségét. Az RNS izolálására szuszpen­­ziós tenyészetben 5Æ108 sejtet növesztettünk, majd 4 nappal a sejtek összegyűjtése előtt 25 14 többek között 1 mM dexametason és 10 mM L­­-trijód-tironin adagolásával indukáltuk a nö­vekedési hormon termelésére. A poliadenilezett RNS-t a tenyésztett sejtek citoplazmatikus membrán-frakciójából izoláltuk az irodalom­ban megadottak szerint eljárva (Martial, Baxter, Goodman és Seeburg, Proc. Natl. Acad. Sei., USA, 74, 1816, 1977: és Bancroft, Wu és Zubay, Proc. Natl. Acad, Sei., USA, 70, 3646, 1973). Ezután az előzőekben az 1—3. példában megadoítak szerint eljárva tovább tisztítjuk az mRNS-t és kétszálú cDNS-t készítünk belőle. Gélelektroforézises frakcionálással egy gyenge, de jól elkülönít­hető sávot kapunk a 800 bázispárnak meg­felelő DNS-nek jelölt helyen. A teljes mRNS-ből kapott cDNS-t Hha 1 endonukleázzal kezeljük, amikor az elektro­forézises elkülönítés után két DNS-nek meg­felelő fragmenset kapunk, amely közelitőleg 320 nukleotidnak (A fragmens) és 240 nukleo­­tidnak (B fragmens) felel meg. Meghatároz­zuk az A és B fragmensek nukleotid-sor­­rendjét, és a vizsgálatok szerint ezek valóban a patkány növekedési hormonjának megfelelő kódokat tartalmazzák, azaz megfelelnek az irodalomban megadott patkány növekedési hormon aminosav-szekvenciára vonatkozó adatoknak és a más ismert növekedési hor­mon szekvenciáknak (Wallis és Davies, Growth Hormone and Related Peptides; szerkesztő: Copecile és Müller, Elsevier, New York, 1976, 1 —14. oldal: továbbá Dayhoff, Atlas of Protein Sequence and Structure, 5, (2) 120—121. oldal. National Biomedical Research Foundation, Washington, 1976). Abban az esetben, ha a 800 bázispárból álló kétszálú cDNS-t a megadott módon elek­­troforézissel izoláljuk, majd szintén a meg­adott módon Hha I endonukleázzal kezeljük, egy a nagyobb hasítási termékek között az A és B fragmenseknek megfelelő hosszúságú két fragmenst találunk. Mivel a körülbelül 800 bázispárból álló és a patkány növekedési hormonját leíró cDNS-t a restrikciós endonukleázzal nem tisz­títottuk, kezelnünk kell a DNS-t a bázispárok nélküli egyszálú végek eltávolítására. Gyakor­latilag úgy járunk el, hogy a pár nélküli szálakat az elektroforetikus elkülönítés előtt távolítjuk el 25 pl 60 mM-os pH 7,5 trisz-hidro­­génkloridot, 8 mM magnézíumkloridot, 10 mM ß-merkaptoetanolt, 1 mM ATP-t és egyenként 200 pM dATP-t, dTTP-t, dGTP-t és dCTP-t tartalmazó reakcióelegyben. A reakcióelegy­hez 1 E E. coli DNS-polimeráz I-et adunk, majd 10 percen át 10 C° hőmérsékleten exonukleolitikusan eltávolítunk minden 3’-vé­­get és szintetizáljuk az 5’-pár nélküli végek megfelelő párját. A DNS-polimeráz I be­szerezhető a következő helyen: Boehringer­­-Mannheim Biochemicals, Indianpolis, In­diana, Egyesült Államok. a A körülbelül 800 bázispárból álló cDNS-t amely a patkány növekedési hormonjának 26 193866 5 10 15 20 25 3C 36 40 45 50 55 60 65

Next

/
Thumbnails
Contents