193504. lajstromszámú szabadalom • Eljárás lúgos foszfatáz géneket tartalmazó rekombinált plazmidok előállítására és alkalmazására

193504 16 záadása után a sejteket 2 órán át 37°C-on in­­kubáljuk, majd 100 ml, 50 fxg/ml ampicil 1 int tartalmazó L táptalajba visszük át és további 16 órán át 37°C-on inkubáljuk. Ennek az ampi­cillines dúsításnak a reakcióelegyéből ugyan­azzal a módszerrel különítünk el egyes fosz­­fatáz-pozítív telepeket, mint amelyet az 1. pél­dában a foszfatáz-negatív mutánsok izolálá­sára alkalmaztunk. Kb. 10000 színtelen telep között mindig volt egy sárga. c.) A pSB47 plazmid elkülönítése és jel­lemzése A sárga telepek közül ismert eljárások sze­rint (G. O. Humphreys et al., Biochem. Bio­­phys.Acta 383., 457—463., 1975) elkülönítünk egy 16,8 milliárd molekulasúlyú plazmidot, amelyet a pSB47 jelzéssel látunk el és amely BamHI-vel végzett hasítás után agaróz gél­ben 2 DNS sávot mutat, ezek: egy 5,8 mil­liárd molekulasúlyú termék (lineáris pBR313) és egy 1 1 milliárd molekulasúlyú termék (kro­­moszóma-pho fragmentum). Az 1. példában felsorolt mutánsok transzformációjával kimu­tattuk, hogy a pSB47 plazmid egy phoA gént tartalmaz. 3. példa A pSB51 plazmid előállítása Az irodalomban ismertetett eljárások sze­rint (G.O. Humphreys et al., Biochem. Bio­­phys. Acta 383., 457—463., 1975) izoláljuk a pWB2 vektor-plazmidot, amely egy, a Hind 111 restrikciós endonukleáz által megtámadható hasítási hellyel rendelkezik és az a m p ici 11 in nel és a kolicin El-gyei szembeni rezisztenciát közvetíti (W. Biodol et al., Molec.Gen.Genet. 152., 231—237., 1977). Az eljárás annyiban különbözik a 2. példában leírttól, hogy az E. coli DNS helyett 45 pl (135 pg/rnl) S. mar­­cescens vad típusból származó kromoszóma­­-DNS-t alkalmazunk és a pWB2 vektort, va­lamint a S. marcescens DNS-t a Hindin rest­rikciós endonukleáZzal hasítjuk. Egy reakció­­elegyet, amely 15 pl pWB2-t (360 pg/ml DNS) 45 pl kromoszóma-DNS-t (135 pg/ml) 60 pl HindlII reakciópuffert (20 mM trisz­-HC1, 20 mM merkapto-etanol, 20 mM MgClj, 180 mM NaCl, pH 7,4) és 60 pl hígított HindlII oldatot tartalmaz, a 2. példa szerint 60 percen át 37°C-on inkubál­juk és az enzim-reakció leállítására 10 percen át 65°C-on tartjuk. A további reakciókat a 2. példa szerint végezzük. A 2. példa szerint elkü­lönített foszfatáz-pozitív telepekből izolálható egy 9,6 milliárd molekulasúlyú, pSB51 jelzésű plazmid, amelyben HindlII-mal való reagál­­tatás után gélelektroforézissel 2 DNS sáv mu­tatható ki, mégpedig egy 7,1 milliárd mole­kulasúlyú (lineáris pWB2) és egy 2,5 milliárd molekulasúlyú (kromoszóma-fragment um). Az 1. példa szerint végzett transzformáció­val kimutatható, hogy a pSBBl csak 1 phoA gént tartalmaz. 15 Az E. coli SB44 által előállított lúgos fosz­­fatázt korongelektroforézissel összehasonlít­juk az E. coli K12 és a S. marcescens megfe­lelő enzimeivel. Ennek érdekében a nyers enzi­meket ozmotikus sokkal izoláljuk az indukált sejtekből (A. Torriani, Procedures in Nucleic Acid Research, p. 224—235., G.L. Cantoni és D.R. Davies, Ed. Harper és Row, Publ., New York, 1966). Közelebbről: 0,5 1, a táblázat szerint előál­lított rázott tenyészetből centrifugálással el­különítjük a (kb. 1,5 g nedves súlyú) sejt - -tömeget, háromszor mossuk 10 mM pH 7,7 trisz-HCI pufferrel és 30 ml szacharóz-oldat­ban (0,5 M szacharóz, 30 mM trisz-HCI, 0,5 mM EDTA, pH 8,0) szuszpendáljuk. A szuszpenziót 10 percen át szobahőmérsékleten kevertetjük. A sejteket centrifugáljuk, 30 ml 3—5°C hőmérsékletű vízben szuszpendáljuk, 10 percen át kevertetjük és ismét centrifugál­juk. A felüItiszóbó 1 ammóniumszulfáttal való 85%-os telítés mellett kicsapjuk a nyers en­zimet, a fehérje-csapadékot 0,6 ml pH 8,5 37 mM trisz-HCI pufferben oldjuk és ugyan­ezzel a pufferrel szemben dializáljuk. A nyers foszfatázok korong-elektroforé­­ziséhez (H.R. Maurer, Disk-EIektrophorese, Verlag Walter de Gruyter, Berlin, 1968) 10%­­os elválasztógélből — 0,185 M pH 8,5 trisz­­-HCl-ban — és 5%-os gyűjtőgélből — 0,037 mM pH 8,5 trisz-HCl-ban — álló akril­­amid gél lemezeket alkalmazunk és az elektro­­forézishez pufferként 0,037M pH 8,5 trisz­­-borát oldatot veszünk. Az elválasztást 450 V feszültség mellett (4 órán át) végezzük. A gél­ben a foszfatáz-sávokat jellegzetes színreak­cióval mutatjuk ki (O. Gabriel, Methods in Enzymology Vol. 22., p. 590., W.B. Jakoby Ed., Academie Press, 1971.), amely az alfa-nafto­­-1-foszfát alfa-naftollá való hidrolízisén és egy azofesték képződésén alapul. A két vonatkozási törzsből származó en­zim-preparátumok az ismert képet mutatják: ez 3 szorosan egymás mellett elhelyezkedő foszfatáz sávból áll, amelyek egyértelműen megkülönböztethetők (a S. marcescens enzim sávjai észrevehetően lassabban futnak, mint az E . coli K12 enziméi). Az E. coli SB44 (pSB51 ) -bői származó enzim a S.marcescens enzimével egyező sáv-képet mutat (1. a 2. áb­rát). 4. példa A pSB53 plazmid előállítása a.) A pSB18 enzim előállítása A pSBI8-at a pBR322 plazmidból állítjuk elő az EcoRI restrikciós szekvencia eltávolí­tásával. A pBR322-t már leírták (Bolivar et al., Gene 2., 95—113. 1977); az e közlemény­ben megadott módon végezzük az elkülöní­tést. A DNS-t DNS-pufferben (45 mM trisz- HCI, 0,1 mM EDTA, pH 7,9) oldjuk és ebben a formában használjuk fel. Az EcoRI restrikciós endonukleázt az iro­dalomból ismert eljárások szerint (P.J. Greene 9 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65

Next

/
Thumbnails
Contents