182462. lajstromszámú szabadalom • Eljárás nukleinsavak keverékeinek affinitáskromatográfiás szétválasztására

T 182 tot tartalmazó színezékeket még szabad, kopoli­­merizálható kettőskötéseket tartalmazó poli-bisz­­-(akril-amid)-ra ojtjuk. A találmány szerinti eljárás során alkalmazott adszorbenst előnyösen úgy állítjuk elő, hogy komplexképzőként . akril-íenil-neutrálvöröset vagy akril-malachitzöldet, további kopolimeri­­zálható monomerként pedig akril-amidot alkal­mazunk, és ezen alkotókból álló kopolimert oj­­tunk a poli[bisz(akril-amid)]-ra. A találmány szerinti eljárás egyik előnyös foganatosítási módja szerint akril-amidból és akril-fenil-neut­­rálvörösből vagy akril-malachitzöldből álló, 200 és 300 közötti polimerizációsfokú kopolimert oj­­tunk fel. Ezen ojtásos kopolimerizációnál a kopolime­­rizálható kettőskötéssel rendelkező, komplex­képző aránya a további kopolimerizálható mono­merekhez előnyösen 1:100 és 1:5000 között van. E reakciót célszerűen 1:3000-as aránnyal hajt­juk végre. Megállapítottuk ugyanakkor, hogy a további monomer és a kopolizálható kettőskö­téssel rendelkező komplexképző közötti kiindu­lási mólarány a kopolimerben is megmarad. A kopolimer 200 és 300 közötti átlagos, illetve kö­zepes polimerizációfoka esetében abból indulha­tunk ki, hogy a ráojtott kopolimerláncok min­denkor csak egyetlen, nukleinsavak számára komplexképzőt hordoznak. A kopolimerek ily módon különböző hosszúságú spacereket alkot­nak a komplexképző és a hordozóanyag, a poli­­[bisz(akril-amid)]-részecskéi között. A találmány szerinti eljárás során alkalma­zott polimer hordozóanyagok szintétikusan egy­szerű módon előállíthatok. Így például a poli­mer hordozóanyagot bisz-akril-amid nagy kon­centrációjú oldatban végrehajtott polimerizálásá­­val kaphatjuk meg. A polimerizációs termék merev, színtelen szilárd anyag, amely igen köny­­nyen dörzsölhető szét olyan jól ülepedő forgá­csokká, amelyek azután többszöri szitálással a kívánt részecskenagyságig homogenizálhatók. A vizes oldatban észlelhető duzzadási viszonyok, illetve duzzadóképesség szélsőséges sókoncent­rációk esetében is állandó(k) és gyakorlatilag független(ek) a kromatográfiánál alkalmazott átfolyási sebességtől. Minthogy e részecskék még számos át nem alakított, polimerizálható kettőskötést tartalmaznak, jól felhasználhatók — amint arra már a megelőzőekben rámutattunk — a további ojtásos polimerizációra. így kapjuk meg az adenin-timin-specifikus akril-malachitzöldből és a guanin-citozin-speci­­fikus akril-fenil-neutrálvörösből az akril-amid­­dal ilyen poli-[bisz(akril-amid)]-részecskék je­lenlétében, vizesoldatban végrehajtott kopoli­­merizációfokú kopolimer 40—50%-a a szokvá­nyos reakciókörülmények. • között ojtott kopoli­­merként kötődik a poli-[bisz(akril-amid)]-ból a hordozórészecskéken. Alapos öblítés után az erő­sen színezett adszorbens részecskéik többé már nem adnak le színezékanyagot és már közvetle­nül felhasználhatók a nukleinsavak affinitáskro­­matográfiájához. A nukleinsavelegyet a szoká­sos eljárási mód szerint 0.01 mólos foszfát-pul­­leroldatban adszorbeáltatjuk az anyagon, majd 8 arról lineáris sógradiens alkalmazásával deszor­­beáltatjuk. Az alkalmazandó só minősége a nukleinsavak jellegétől függ. Amíg a ribonuk­leinsavak deszorpciójához — ideértve a transz­­fer-ribonuklinsavakat is — a nátrium-klorid al­kalmazása elegendő, a DNA-nak az akril-ma­­lachitzöld tartalmú adszorbensekről történő eluálásához perklorát használatára van szükség. Kutatásaink során azt találtuk, hogy hordo­zóanyagot úgy is előállíthatunk, ha hidroxi-, il­letve aminocsoportokat tartalmazó, oldhatatlan, gyöngyalakú anyagokból indulunk ... Előnyös, túlnyomórészt szerkezetspecifikus komplexképző a 9-(akriloil-amino-etil-amino)-2- metoxi-6-klór-akridin, amelynél a gyűrűrend­szeren aminocsoport található, amely a DNA foszfátcsoportjaihoz való kapcsolódást lehetővé teszi. Akridinszármazékok, például a 9-(akriloil­­amino-etil-amino)-2-metoxi-6-klór-akridin a bisz(akril-amid)-részecskékhez történt kapcsoló­dásukat követően a bázisra nem specifikusan választják el a kettősláncú DNA-t a szuperheli­­kális (supercolied) DNA-tól (1. a 7. sz. ábra elu­­ciós diagramját). Ez a tény a plazmid- és vírus- DNA-k feltárt sejtekből történő egyszerű levá­lasztása szempontjából igen fontos. Az oszlop helyettesíti a költséges etidium-bromid-cézium­­klorid-gradienst. Ezt az elválasztást az akriloil­­amino-fenil-neutrálvörös-oszloppal is elvégez­hetjük, tekintettel arra, hogy a DNA-val mind­két színezék hasonló szerkezetű komplexet (in­­terkalációs komplexet) alkot. Az akriloil-amino­­fenil-neutrálvörös szerkezet- és bázisspecifiku­­san is szétválaszt. Ez lehetőséget ad arra, hogy a megoldandó szétválasztási vagy elválasztási problémáknak megfelelően, illetve attól füg­gően, az adszorbens összetételét illetően egy sor változatot alakíthassunk ki. Minthogy a komplexképzők stabil kovalens szén—szén-kötésen keresztül kapcsolódnak, ezért a találmány szerinti eljárásban alkalmazott ad­­szorbensek szélsőségesebb pH-értékeknél is al­kalmazhatók, detergensekkel moshatók és sóol­datokkal regenerálhatók. Emellett lehetőség van arra, hogy több, különböző komplexképzőt vagy monomert építsünk be, aminek következtében olyan adszorbenseket alakíthatunk ki, amelyek transzfer-nukleinsavak felbontására is alkalma, sak. A ráojtott kopolimerek lánchossza és ennek következtében a polimer hordozóanyag és a komplexképző közötti láncok hossza a szokásos módon, merkapto-etil-alkohollal irányítható, sza­bályozható. A találmányt részletesebben példákon mu­tatjuk be, amelyekben a mellékelt ábrákra hi­vatkozunk. -Az ábrákon az alábbiakat szemléltetjük: 1. ábra: A találmány szerinti eljárás során előnyösen alkalmazott adszorbensek kétlépéses polimerizációval történő előállításának folya­matvázlata; éspedig 1. polimerizáció: az 1 bisz­­(akril-amid)-oldat polimerizációjával 2 gél ke­letkezik, ennek fragmentálásával 3 fragmentu­mok képződnek, 2. polimerizáció: fragmentu-462 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65

Next

/
Thumbnails
Contents