Hidrológiai Közlöny 2010 (90. évfolyam)

6. szám - LI: Hidrobiológus Napok: „Új módszerek és eljárások a hidrobiológiában” Tihany, 2009. szeptember 30–október 2.

56 HIDROLÓGIAI KÖZLÖNY 2010. 90. ÉVF. 6. SZ. Heterotróf ostorosok sejtszerkezetének térbeli rekonstrukciója áteső megvilágítású fénymikroszkópos optikai szeletekből. Kiss Áron Keve, Ács Éva, Kiss Keve Tihamér MTA ÖBKI Magyar Dunakutató Állomás, 2131. Göd. Jávorka S. u. 14. Kivonat: A jelen dolgozatban egy új video-mikrogáfiás módszert ismertetünk, melynek segítségével élő, mozgó eukarióta mikroorga­nizmusokról készíthetők nagyfelbontású és nagy kontraszttal rendelkező videofelvételek, és elkészíthető a szervezetek sejt ill. testszerkezetének általános térbeli rekonstrukciója. A módszer nagy numerikus apertúrájú objektívvel ellátott, Nomarski DIC kontrasztosítású fordított mikroszkópot alkalmaz. A minta egy mikroakváriumban található, a kondenzorlencse beleér a vízmintába. Az élőlényekről analóg kamera és külső A/D konverter segítségével digitalizált videofelvételeket készítünk me­revlemezre. A videofelvételek elemzésével, képkockák kivágásával és képelemzési eljárásokkal nagyon részletgazdag felvé­telek kaphatók. Az objektív z-irányú mozgatása közben készített videofelvételekből optikai szeletsorozat nyerhető. Az áteső fényű DIC kontrasztosítású képekből zajszűrés után differencális kontrasztosítással vagy egy derivativ, pseudo-térhatást oko­zó szűrő használatával a háromdimenziós rekonstrukcióhoz megfelelő optikai szeletek állíthatók elő. A háromdimenziós re­konstrukció után sok különféle sejtalkotó térbeli helyzete megfigyelhető (pl. magszerkezet, ostorok alapi teste). Mind a szerkezetvizsgálatok, mind az időbeli vizsgálatok számos fontos szerkezeti és funkcionális tulajdonság megfigyelésére adnak lehetőséget mind egysejtűeknél, mind metazoáknál. fénymikroszkóp, video, háromdimenziós szerkezet rekonstrukció, DIC, heterotróf ostoros Kulcsszavak: Bevezetés A modern fénymikroszkópos módszerek elterjedése komoly áttörést jelent az utóbbi két évtizedben az élettu­dományok területén. A két legnagyobb hatású újítást fel­tehetően a fluoreszcens mikroszkópia és az optikai szele­telő technikák elterjedése jelenti. A fluoreszcens festé­kekkel specifikusan lehet festeni sejteket, sejtszervecské­ket, molekulákat, az optikai szeletekből pedig a modern számítógépes háttér segítségével a struktúrák háromdi­menziós rekonstrukciója válik lehetővé. Az eddig első­sorban az élettan, molekuláris biológia és immunológia területén elterjedt módszerek a mikrobiális ökológiában is új területeket nyitnak meg (pl. baktériumok, heterotróf ostorosok számlálása, Porter és Fieg 1980; biofllm szer­kezetvizsgálatok konfokális lézer pásztázó mikroszkóp­pal, Kuehn és mtsai 1998; videomikrográfia használata ostorosok táplálékfelvételének vizsgálatában, Boenigk és Arndt 2000). Ennek ellenére az eukarióta mikrobiológiá­ban és a hidrobiológiái vizsgálatokban csak szórványo­san fordulnak elő ezek a gyakran kevéssé ismert, de igen nagy perspektívával rendelkező módszerek. Jelen dolgozat célja egy új módszer bemutatása, mel­lyel élő eukarióta mikroorganizmusok tanulmányozhatók nagy-felbontású és nagy kontraszttal rendelkező video­felvételek segítségével, és elkészíthető a szervezetek sejt ill. testszerkezetének általános térbeli rekonstrukciója. A háromdimenziós szerkezetrekonstrukció áteső megvilá­gítású optikai szeletek kombinációjával készül, mellyel ­az eddigi kizárólagos fluoreszcens megvilágítással szem­ben - a rekonstrukcióban minden, a citoplazmától eltérő fénytörésü sejtalkotó megjelenik, így az általános sejt­szerkezet átfogóan tanulmányozhatóvá válik. További ú­jítást jelent a mozgó sejtek vizsgálatának lehetősége, melynek segítségével sok nagyon fontos funkcionális in­formáció szerezhető a szervezetről. A módszer részletes bemutatásán túl kitérünk a lehetséges alkalmazásokra, az eddig elért eredményekre és a továbbfejlesztési lehetősé­gekre is. A módszer részletes ismertetése Fénymikroszkóp: A vizsgálatban fordított mikrosz­kópot használtunk (Olympus IX-70), amellyel a felületen mozgó élőlények, illetve azok ventrális oldala is jól ta­nulmányozható. Az alkalmazott nagy apertúrájú, kis mélységélességű objektív (1,3 NA Hl) kis mélységéles­sége miatt optikai szeletek felvételére alkalmas. A víz­minta egy mikroakváriumban helyezkedik el, amelynek alját a fedőlemez alkotja, a folyadék oldalsó meniszku­szát egy középen köralakú lyukkal rendelkező műanyag lap biztosítja, a kondenzorlencse pedig beleér a vízmin­tába {la ábra). Bár a tárgylemez és a kondenzorolaj hiá­nya némi alulkorrekciót okoz, az elrendezés egy nagyon hasznos mechanikai pufferként szolgál: az objektív moz­gatása során alig hat erő a víztérre, így a felületen kiüle­pedő aggregátumokat és az ott mozgó szervezeteket nem éri nyomás. Erős, sötétlátótérhez közeli Nomarski DIC kontrasztosítást alkalmaztunk, a sejteket 1500x nagyítá­son vizsgáltuk. Videofelvétel: A videofelvételeket egy analóg 3CCD kamerával készítettük (JVC KY-F30B). A jelet egy Ana­lóg/Digitális konverter segítségével digitalizáltuk (Dazz­le Hollywood DV Bridge, ill. Canopus ADVC-300), és számítógép merevlemezre rögzítettük. A digitalizálás so­rán 4D zajszűrést is használtunk (különböző idejű kép­kockák összevetése statisztikai zajszűrésre). Az analóg videokamera használatának a következő előnyei vannak: a kamera paraméterei állíthatók, a digitalizálás során többlet fényerő és kontraszt adható a felvételekre, és a legfontosabb, hogy tömörítetlen felvétel rögzítése lehet­séges a merevlemezre, így a video képkockái kivághatok és fényképként kezelhetők. Videofelvételek vizsgálata: A videofelvételek utóla­gos visszajátszásával a mozgó élőlények nyugodtan, képkockáról képkockára léptetve vizsgálhatók, részlete­sen megfigyelhetők. Ennek a ritka fajok vizsgálatában nagyon nagy jelentősége van. A videók elemzését több­let digitális kontrasztosítás mellett végeztük (Virtual­Dub). A mozgó képeken gyakran a leghalványabb struk­túrák is észrevehetőek, melyek az állóképeken beleol­vadnak a háttérzajba. A videofelvételek elemzésével a mozgások sebessége mérhető, illetve sejtmozgásoknál a sejtrészecskék nyomkövetése lehetséges (NikonPro). A videókból további képelemzés céljára képkockákat vág­tunk ki (Pinaccle Studio Launcher), melyek mérete 720 x 580 pixel. Képelemzés: A képelemzés célja a képkockák átala­kítása oly módon, hogy a legtöbb vizuális és mérési in­formáció legyen megszerezhető a képből. A képelemzés során végzett főbb lépések az esetleges csíkok eltünteté­se a képről, a zajszűrés és a kontrasztosítás. A következő műveleteket végeztük el: 1. a színes kép szürke-árnyala­tossá tétele (Olympus CellD), 2. a kép Fourier-transzfor­mációja. 3. a csíkokat okozó foltok törlése a Fourier-spe-

Next

/
Thumbnails
Contents