Szemészet, 2002 (139. évfolyam, 1-4. szám)

2002-03-01 / 1. szám

56 §g§§§j Szemészet Thumb telomer polimeraz dómén telomeráz RNS 1. ábra. A telomeráz enzim szerkezete A telomeráz kvantitatív detektálása azonban meglehető­sen bonyolult feladat a sejtekből, szövetekből kinyerhető enzim csekély aktivitása miatt. Végül Kim és mtsai 1994- ben kifejlesztettek egy PCR (polymerase chain reaction) alapú telomerázmérési módszert, a TRAP (Telomeric Repeat Amplification Protocol) assay-t.10 Ez a szenzitív módszer lehetővé tette a telomerázmérést kisméretű tumo­rok esetében is, például akár 100 sejtből álló szolid dagana­tokból is. E módszert alapul véve munkacsoportunk kidolgozott egy módosított, egyszerűbb telomerázmérési protokollt, a TP-TRAP-t (two primer-TRAP).16,17 A szemészeti tumorok eseteiben a telomeráz enzim sze­repéről kevés irodalmi adat ismert.7,14 Ezen közlemények az eredeti mérési assay-n alapulnak.10 Munkánkban a tumorminták telomeráz aktivitásának mérésére az új proto­kollt használtuk.16 A munkacsoportunk által módosított, kvantitatív meghatározásra kiválóan alkalmas mérési proto­kollt elsőként alkalmaztuk szemészeti tumorok eseteiben. Az új diagnosztikai módszer lehetővé teszi a daganat rend­kívül kis mérete esetén is (néhány mikrogramm) a telome­­rázaktivitás detektálását. 2. A telomerázaktivitás detektálása A telomerázméréshez szükséges oligonukleotidokat la­boratóriumunkban szintetizáltuk a Pharmacia Gene As­sembler Plus oligonukleotidszintetizáló készüléken. A PCR-reakcióhoz felhasznált primerek tisztítása gélelektro­­forézissel történt. A telomerázmérésekhez felhasznált oligonukleotidok: MTS primer: 5 ’ -AGCATCCGTCGAGCAGAGTT-3 ’ RP primer: 5' -TAG AGC AC AGCCTGTCCGTG-3 ’ RPC3 primer: 5 ’ -TAG AGC AC AGCCTGTCCGTG (СТА ACC)3-3 ’ A telomerázaktivitást az általunk módosított PCR alapú, kvantitatív mérési módszerrel határoztuk meg.16,17 A mérés egyszerűsített elve a 2. ábrán látható. E módszer esetén a PCR-reakció nagy részében a reverz primer nem random módon, hanem csak a DNS- fragmentek terminális régiójához kötődik, így a létrejövő PCR-termékek hossza jól reprezentálja a telomeráz enzim által generált repeat-ek hosszát. A keletkező PCR-terméket 5%-os TCA-val csaptuk ki, a precipitátumot GF/C üvegszűrőn izoláltuk, a csapadék ra­dioaktivitását folyadék-szcintillációs méréssel határoztuk meg. A tumorminták esetében a detektálás érzékenységének növelése érdekében a PCR-ciklusszámot a legtöbb esetben megemeltük 27-ről 29-re. A TP-TRAP összefoglaló lépése­it a 2. ábra tartalmazza. Összesen 24, szemészek által eltávolított, különböző ré­gióból származó tumorminta került feldolgozásra. Tizen­négy intraocularis tumorból valamint tíz szemhéjon és peri­­orbitalisan elhelyezkedő tériméből származó mintát hasz­náltunk. A végleges diagnózist a kórszövettani feldolgozás után állapítottuk meg. A vizsgálat menetének algoritmusát a 3. ábrán tüntettük fel. Tekintettel a minták alacsony számára, statisztikai analí­zist nem végeztünk. Néhány kontroll vizsgálat esetén a radioaktív jelölést el­hagytuk és a PCR-produktumokat 10%-os poliakrilamid gélen választottuk el (futtatás 2 órán át, 300 V-n). A szétvá-Anyag és módszer 1. Telomerázt tartalmazó extraktumok készítése Vizsgálataink előtt számos sejtvonalat teszteltünk és vé­gül a HL-60 (human promyelocytás leukaemia) sejtet vá­lasztottuk, mivel könnyen tenyészthető és magas a telome­­rázszintje. Ezekből, illetve a Szemészeti Klinika műtéti anyagából származó tumorszövetekből telomerázt tartalma­zó sejt-, illetve szövetextraktumokat készítettünk. Az ext­raktumok készítéséhez a Kim és mtsai által bevezett deter­gens lízis módszert alkalmaztuk.10 A minták proteinkon­centrációját Bio-Rad protein-assay segítségével határoztuk meg. A minták intaktságának ellenőrzésére megmértük ALP (alkalikus foszfatáz) aktivitásukat. Csak azon minták szerepeltek a későbbi vizsgálatokban, amelyek detektálható ALP aktivitással rendelkeztek. MTS primer 1 . elongacio telomerazzal (30 percig, 30 C-on) -------------------------------------------► I 1-2 PCR-ciklus alacsonyabb hőmérsékleten-4-----------------------------------­RPC3 primer 3-29 PCR-ciklusok magasabb hőmérsékleten ▼ ◄----------------------------------­MTS primer RP primer-------------------► 2. ábra. A TP-TRAP assay alapelve Kemény-Beke Adám

Next

/
Oldalképek
Tartalom