196236. lajstromszámú szabadalom • Eljárás hepatitis B vírus antigenicitást mutató polipeptidek előállítására

1 198236 2 Természetesen más ismert módszer is alkalmaz­ható DNS molekulák kialakítása céljából. Ilyen pl. a közvetlen ligáció, ahol ugyan azt a restrikciós endonukleázt használják a HBV DNS és a klón­­képző hordozó hasítására. Ezzel az eljárással egy­ben komplementer végeket kapunk a kohézióhoz. Természetesen magától értetődik, hogy a klón­­kcpzó hordozó kiválasztott restrikciós helyén be­épített nukleotid szekvencia vagy gén fragment olyan nukleotidokat is magában foglalhat, ame­lyek nem képezik a valódi Struktur gén részét a kívánt protein esetében vagy a Struktur génnek csak egy fragmentjét foglalják magukban. Csak az szükséges, hogy bármilyen DNS épül is be, a transzformált gazdasejt HBV antigenicitást muta­tó polipeptidet termeljen. A hibrid gént tartalmazó rekombínáns DNS molekulát alkalmazhatjuk a gazdasejt transzfor­málásra, úgy hogy a gazdasejt (transzformáns) a Struktur gént vagy fragmentjét fejezze ki és olyan polipeptidet vagy részét termelje, amelyet a hidrid DNS kódol. A rekombináns NDS molekula a gazdasejtet úgy is transzformálhatja, hogy a gazda­sejt replikációval további rekombináns DNS mole­kulát termeljen mint a HBV struktúrgének és fragmentjeik forrását. A fenti céloknak megfelelő gazda kiválasztása számos, az irodalomból ismert tényezőtől függ. Ilyen tényezők pl. kompatibilitás, a melléktermékek toxicitása, a polipeptid termék kinyerésének egyszerűsége, kifejeződési jellem­zők, biológiai biztonság és költségek. Mivel a kifejeződés mechanizmusa még nem teljesen felde­rített, a speciális rekombináns DNS molekulához vagy polipeptidhez a gazdasejtet nem lehet tökéle­tesen megválasztani kizárólag a fenti faktorok alapján. A tényezők egyensúlyát kell megtalálni annak felismerése mellett, hogy nem minden gaz­dasejt hat egyformán egy adott rekombináns DNS molekula kifejeződésére. A találmány szerinti szintézisben az előnyös kiónképző hordozó a bak­teriális pBR322 plazmid és ebben az előnyös restrikciós endonukleáz hely a Pst 1 hely (2. ábra). Ez a plazmid kb. 2,6 megadalton molekula súlyú kis plazmid, amely az ampicillin (Amp.) és tetra­­ciklin (Tét) antibiotikumokkal szemben mutatott rezisztencia géneket hordozza. A plazinidot telje­sen jellemezték (F. Bolivar és társai: „Constructi­on and Characterization of New Cloning Vehicles II. A Multipurpose Cloning System”, Gene 95— 113 o. (1977)). A találmány szerinti legelőnyösebb gazdasejl az E. coli HB 10i. 1. dC-vel meghosszabbítón Dane-részecske DNS előállítása A találmány szerinti eljárás egyik előnyös foga­­natosítási módja szerint a fent leírt módon Dane­­részecskéből izolált D.NS-t Kpn I restrikciós nukie­­ázzal (kb. 20 ng DNS 10 pl 10 mmólos trisz-HCl, pH=7,5, 10 mmólos magnézium-klorid, 10 mmó­los 2-merkapto etanol, 40 mmólos nátrium-klorid, 0,5 pl enzim készítmény elegyében) 37°C-on 90 percig emésztjük és a restrikciós enzimet 70 °C-on történő melegítéssel 5 percig inaktiváljuk. Az emésztés után kapott terméket 3' végéhez (a 2. ábrán CCC-nek jelölve) polinukleotid terminális transzferázzal* végzett standard reakcióval polide- Zoxi-C szekvendiákat kapcsoltunk, miután a mara­dék proteint 20 pl fenollal és 20 pl kloroformmali extraháltunk és eltávolítottuk. A fenolt éteres extrakcióval távolítottuk el a vizes fázisból és a DNS-t 5 pl 6,5 pH-értékű 3 mólos nátrium-acetát cs 0,1 ml hideg etanoi hozzáadásával kicsaptuk. Egy óráig -70°C-on tároljuk, majd a kicsapott DNS-t percenként 10000 fordulatszámmal 20 per­cig centrifugálva izoláltuk és a pelletet 10 pl 10 mmólos pH=7,5 értékű trisz-HCl-ben oldottuk. Ehhez 3 pl 400 mmólos kálium-kakodiláiot, pH=7,0, 4 mmólos kobaltkloridot és 4 mmólos dezoxieitozin-trifoszfátot (dCTP), 200 pl/ml mar­­haszérum-albumint tartalmazó elegyet adagoltunk és az elegyet 27°C-on 10 percig 0,5 pl polinukleo­tid terminális transzferázzal (6000 egység/ml) indu­káljuk és a reakciót 50 mmólos EDTA l pl-ének hozzáadásával megállítottuk. 2. Pst l-gyel hasított, dC-vel meghosszabbított pBR322 előállítása A pBR322 plazmidot Pst I restrikciós endonuk- leázzal elbontjuk (amely számára plazmid egy célpontot tartalmaz) és a terméket fenolos extrak­­cióvai és etanolos kicsapással tisztítjuk a HBV— DNS-nél megadott módon. A poli-dó szekvendiá­­kát (illusztráció céljából lásd. a 2. ábrán a GGG-t) terminális transzferázzal a lineáris pBR322 mole­kulát 3' végéhez kapcsoljuk, ugyanúgy, ahogy a poli-dC szekvenciákat kapcsoltuk össze a HB V-vel azzal a különbséggel, hogy a reakciót 37°C-on végeztük el. 3. Poli-G-vel meghosszabbított pBR322 és poli- C-vel meghosszabbított HBV DNS kohéziója Ekvimoláris mennyiségű pBR322-poli-dG-t és HBV-DNS-poli-dC-t összekeverünk és a komple­menter szekvenciákat 50 ml TNE-keverékben TNE: 100 mmólos nátriumklorid, 50 mmólos trisz- HCl, -pH=7,5, 5 mmólos (EDTA) 65°C-on 1 óráig, majd 47 °C-on l óráig, majd 37°C-on 1 óráig és 20 C-on egy óráig inkubálva összekapcsoljuk és még egyenlő térfogatú TNE-t és 20 pl 100 mmólos inagnéziumklorid, 100 mmólos kalciumklorid, 100 mmólos trisz-HCl (pH=7,5) keveréket adunk hoz­zá. 4. E. coli HBW1 transzformálása Transzformációhoz alkalmas E. coli HB 101 kul­túrákat állítottunk elő E. M. Ledírberg és S. H. Cohen „Transformation of Salmonella typhymuri- uni by plasmid Deoxyribonucleic Acid”, J. Bacte- riol., 119, 1072 — 1074 o. [1974] közleménye sze­rint. A sejtek 0,1 ml-es adagjait 25 pl temperált DNS készítménnyel összekeverjük és 0°C-on 20 percig, majd 20°C-on 10 percig inkubáljuk mielőtt 50 pg/ml tetraciklint tartalmazó L-agar-lemezefo * (Nucleic Acids Research, 3. 101 —15 a, (1976)) 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60 65 6

Next

/
Oldalképek
Tartalom