Hidrológiai Közlöny 2008 (88. évfolyam)

6. szám - IL. Hidrobiológus Napok: „A Balaton és vízrendszere – a Balaton-kutatás története” és „A Duna-kutatás története” Tihany, 2007. október 3–5.

109 juk ismeretében az adott génre tervezett specifikus oligo­nukleotidokkal (15-25 bázis hosszúságú DNS szakaszok, primerek) azonosíthatóak és polimeráz láncreakció (PC­R) segítségével kimutathatóvá válnak. A beállított mód­szerek segítségével megkezdődött a természetes vizek fi­toplanktonjának átvilágítása, toxikus genotípusok azono­sítása. A mikrocisztinek családjába sorolt több mint 50 féle variáns számos cianobaktérium fajban megtalálható, s köztük is leggyakrabban Microcystis, Planktothrix és A­nabaena fajokban (Mez és mtsai, 1997; Frazier és mtsai, 1998). A nodularint a Nodularia spumigena cianobakté­riumban mutatták ki (Mazur és Plinski, 2003), a cilindro­spermopszint pedig a Cylindrospermopsis raciborskii, A­phanizomenon flos-aquae, Aphanizomenon ovalisporum, Anabaena bergii, Raphidiopsis curvata és Raphidiopsis mediterranea fajokban azonosították (Banker és mtsai, 1997; Li és mtsai, 2001; Schembri és mtsai, 2001; Preu­ßel és mtsai, 2006; Mohamed, 2007). Ezek a vízvirág­zást, vízszíneződést okozó cianobaktériumok a közönsé­ges fitoplankton tagjai hazai vizeinknek is. A mikrocisztinek és a nodularin hepatotoxin, kémiai szerkezetüket tekintve ciklikus peptidek, a szerin/treonin fehérje foszfatáz 1 és 2A inhibitorai (MacKintos és mts­ai, 1990). A mikrocisztinek szintézisét a mikrocisztin­szintetáz komplex végzi, melyek enzimeit a mcy gének (mcyABCDEFGHIJ) kódolják (1 ábra). A nodularin a nod gének átírását követően szintetizálódik (Dittmann és Wiegand, 2006) . McyE McyD McyA 1. ábra. A hepatotoxinok szintéziséért felelős gének általános struktúrája (Dittmann és Wiegand, 2006) A cilindrospermopszin kémiai természetét tekintve egy alkaloid, amely szintén hepatotoxikus (Hawkins és mtsai, 1985), de fehérjeszintézist gátló hatással is rendel­kezik (Terao és mtsai, 1994), továbbá indukálhat karci­nogenezist (Humpage és mtsai, 2000) vagy okozhat neu­rotoxicitást is (Kiss és mtsai, 2002). Három feltételezett enzim vesz részt a cilindrospermopszin szintézisében, az amidinotranszferáz, peptid-szintetáz és a poliketid-szin­táz (Kellmann és mtsai, 2006, 2. ábra). A toxikus genotípus jelenlétének kimutatása a toxin szin­tézisben kulcsszerepet játszó enzimek génjeinek (mcyAQC­DEFGHIJ, nod, PS, PKS), specifikus szakaszaira tervezett oligonukleotidok segítségével történik (Schembri és mtsai, 2001; Tillett és mtsai, 2001; Rantala és mtsai, 2004; Valé­rio és mtsai, 2005). A PCR reakciók során a terepmintákkal egy időben izolált törzsek is vizsgálhatók igazoltan toxinter­melő törzsek DNS mintáit alkalmazva kontrollként (Kovács és mtsai, 2007). A potenciális toxintermelő képesség kimu­tatása mellett a módszer lehetőséget nyújt a faj ill. csoport specifikus primerek alkalmazásával a potenciálisan toxikus genotípus rendszertani besorolására is. ücxj glicin i aniu amidinotranszferáz \IS 16"/ -N cilindrospermopszin HaN. V •HjN — N COO guamdin-acetát ATP* malonil-CoA - J pcptid-szintl'tá/. A DP «P, «• CoASH • HCO, inalonil-CoA HjN. > « ""r v , CoASH • HTO, poliketid-s/.intáz /-a S-ACP poliketid-szintáz (ketoreduktáz) Íí Q S-ACP 2. ábra. A cilindrospermopszin bioszintézisében részt vevő gének valószínűsített katalizációs reakciói (Kellmann és mtsai, 2006 nyomán). A toxintermelő képesség molekuláris módszerekkel való kimutatásának gyakorlati vonatkozásai A PCR technikát alkalmazó molekuláris megközelítés előnye az érzékenység és a korai detektálás. Már az algavi­rágzást megelőző korai, kevés fonalszámú stádiumban előre jelezhető potenciálisan toxint termelő változatok jelenléte az algapopulációban. A természetes vizek algaflórájában kis mennyiségben jelenlevő, valamit az üledékben lappangó potenciálisan toxint termelő genotípusok jelenléte is detek­tálható, amelyek kimutatására a mikroszkópi vizsgálat vagy a már szintetizálódott toxin kimutatásán alapuló módszerek nem alkalmasak. A molekuláris biológiai vizsgálat során kapott eredményeket azonban a módszer korlátainak isme­retében kell értelmezni. A kérdéses gének kimutatása során a 3. ábrán látható folyamatsort végezzük el a mintavételtől az azonosításig. Három lehetséges hibaforrást azonban figyelembe kell venni az eredmények értékelésénél. (i) Mintavétel; Az időbeli és térbeli mozaikosság minden limnológiával foglalkozó kutatónak problémákat vet fel. Az algák, s valószínűleg a toxikus genotípusok eloszlása sem e­gyenletes az adott víztérben. A negatív eredmény környezeti mintáknál valószínűsíti a toxikus genotípusok hiányát, de a mintavételi hely heterogenitásából következően nem garan­tálja azt (meg kell jegyezni, hogy ez a többi módszer eseté­ben is igaz). Ugyanakkor a pozitív eredmény viszont egyér­telműen jelzi a potenciálisan toxintermelésre képes genotí­pusokjelenlétét. (ii) Kimutathatósági határ; A PCR reakció egy nagyon érzékeny módszer, elméletileg az egy kópiában levő célgén is kimutatható, azonban a gyakorlatban ez nem feltétlenül érvényesül. Ezért fontos meghatározni a módszer érzékeny­ségét, azaz azt a legkisebb fonal- vagy sejtszámot, aminél pozitív eredményt kaphatunk. A 3. ábrán vázolt módszer érzékenységét a cilindrosper­mopszin toxin esetében kísérletesen teszteltük. A C. racibo­rskii CYN termelő és nem termelő törzseit különböző ará­nyokban kevertük kiindulva egy közepes algavirágzás fo­nalszámából. A teszt eredménye azt mutatja, hogy a minta­előkészítés, DNS preparálás, PCR reakció folyamatsorban 1420 nem toxikus fonal között 1 toxikus fonalat tudtunk még biztosan detektálni (4. ábra, 2. táblázat).

Next

/
Oldalképek
Tartalom