Hidrológiai Közlöny 2003 (83. évfolyam)

XLIV. Hidrobiológus Napok: "Ritkán vizsgált és különleges vizek" Tihany, 2002. október 2-4.

129 kaptuk, azaz ezzel a módszerrel a fenti két minta bizonyult a legdiverzebbnek FNA FNE GNA GNE LNA LNE 2. á^ra. /í Velencei-ló nádbevonata bakteriális közösségi PCR termékeinek DGGE gélképe (a nyilak az elkiilöniilö csikókat jelölik) A DGGE mintázatból kivágott diszkrét sávok DNS-ének szekvencia analízise a domináns fajok tekintetében (pl Ba­cillus, Pseudomonas) megegyezett a tenyésztésen alapuló baktérium identifikáció eredményeivel Köszönetnyilvánítás A fenti kutatásokat az OTK.A T032444 sz pályázatának és a Közép-dunántúli Környezetvédelmi Felügyelőségnek a támogatásával végeztük. Irodalom Altschul, S. F., Madden. T. I., ScháJJer. A. A.. Zhang. J„ '/.hang. 7... Miller. W„ Lipman, D. J : Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs Nucleic Acids Res 25: 3389-3402, 1997. Amann, It, Lemmer, H., Wagner, M. : Monitoring the community struc­ture of wasrewater treatment plants: a comparison of old and new techniques. FEMS Microbiology Ecology 25: 205-215, 1998 Costerton, J. W., Lewandowski, Z.. Caldwell, D. E., Korber, D. R.. Lappin-Scott, H. M.\ Microbial biofilms Aruiu. Rev Microbiol. 49: 711-745, 1995. Horikoshi. K.: Microorganisms in Alkaline Environments. Weinheim: VCH Verlaggesellschaft, 1991. iMkatos, Cy., Grigorszky, I., Bird, P. Reed-periphyton complex in the littoral of shallow lakes. Verh. Internet. Verein. Limnol. 26: 1852­1856, 1998. Poindexter, J. S. Dimorphic prosthecate bactcna: the Genera Caulobac­ter, Asticcacaulis, Hyphomicrobium, Hyphomonas, Thiodendron In: Balows.A, TrüperJi.G., Dworkin.M., Harder,W., Schleifer,K (ed.): The Prokaryotes. Springer­Verl. NewYork 3:2176-2196, 1991. Szabó, I., Szeglet, P., Tóth, /.: Preliminary case study of sludge depositi­on around the Keszthely bay of the lake Balaton First International Confer, on Environmental Engineering, Leicester, England, 1993. Massol-Deya, A. A., D. A. Ode/son, R. F. Hickey & J. M. Tiedje: Bacte­rial community fingerprinting of amplified 16S and 16-23S nboso­mal DNA gene sequences and restriction cndonuclease analysis (ARDRA). In Akkermans, A. D. /,., J. D vwi Elsas & F. J. de Bru­inj (eds.) Molecular Microbial Ecology Manual Kluwer Academic Publishers, London, 3.3.2: 1-8, 1995 Muyzer, G., de Waal, E. C„ Villerlinden, A. G: Profiling of complex microbial populations by denaturing gradient gel electrophoresis a­nalysis of polimerase chain reaction-amplified genes coding for 16S rRNA. Appl. Environ. Microbiol 59 695-700, 1993. Muyzer, G., Smalla, K. : Application of denaturing gradient gel electro­phoresis (DGGE) and temperature gradient gel electrophoresis (TGGE) in microbial ecology Antonie van teeuwenhoek 73: 127­141, 1998. Investigations on reed stem biofilm bacterial communities in Lake Velencei using traditional and molecular methods Rusznyák A., Borsodi A., Vladár P., Molnár P., Reskóné ÍV. M, Ács É. Abstract: From three reed biofilm samples of Lake Velencei 479 bacterial isolates were gained after serial dilutions and plating onto different media After a primary selection 251 strains were investigated by „traditional" phcnoivpic tests and clustered by numerical aillysis 30 representative strains were selected to ARDRA and 16S rDN'A sequence analysis to identify the taxa llie identified genera were Bacillus, Aureobacteium, Pseudomonas, Agrobacteriuni and Aeromonas. DGGE results gave unique community fingerprints of the studied samples and the DNA sequences from excised bands showed the same dominant species Keywords: Lake Velencei, biofilm, phenotypical grouping of bacterial strains, ARDRA, 16S rDNS sequence analysis, IXiGE

Next

/
  • Elrendezés
  • Igazítás
  • Forgatás
Oldalképek
Tartalom