Vízügyi Közlemények, 2021 (103. évfolyam)
2021 / 2. szám - Róka Eszter, Khayer Bernadett, Kis Zoltán, Kovács Luca Bella, Magyar Nóra, Málnási Tibor, Oravecz Orsolya, Pályi Bernadett, Pándics Tamás, Schuler Eszter, Vargha Márta: A járványkezelés új eszköze: a szennyvíz alapú epidemiológia
Vízügyi Közlemények, Cili. évfolyam, 2021. évi 2. füzet 17 környéki agglomeráció több települése is szolgáltat mintát a vizsgálathoz, ezeket egyesített mintaként vizsgáljuk. A vizsgált 26 szennyvíztelep összesen 3,9 millió lakost lát el, vagyis az ország lakosságának közel 40%-át reprezentálja (7. táblázat). A mintákat a szennyvíztelepek munkatársai veszik heti rendszerességgel, a hűtve szállításról a kormányhivatalok gondoskodnak. A minták feldolgozása a Nemzeti Népegészségügyi Központban (NNK) a mintavételtől számított 24 órán belül megkezdődik. 3.2. Mintafeldolgozás A szennyvízmintákból a laboratóriumba szállítást követően centrifugálással távolijuk el az ülepedő szennyeződéseket. A mintafeldolgozás következő lépése a víniskoncentrálás, melynek célja a vízmintában található lehető legtöbb vírus kis térfogatban történő összegyűjtése. A mintákból 50 ml-t koncentrálunk egy egyedileg gyártott ultraszűrő lapmembránon (SUEZ WTS, Magyarország), vákuum segítségével. A membránról a vírust vírus transzpont médiummal nyeljük vissza. A szűrés során nyert koncentrátumból a nukleinsav kivonása kereskedelmi forgalomban kapható kittel történik (Qiagen QIAamp Viral RNA mini kit, Qiagen, Németország). A vims örökítőanyagának mennyiségi meghatározására kvantitatív PCR módszert használunk. A vírus örökítőanyagának specifikus felszaporítása a CDC által ajánlott NI primer szett segítségével történik (Roche LightCycler Multiplex RNA Virus Master kit, LightCycler 480 Instrument II kvantitatív PCR rendszer). Mennyiségi standardként az Európai Betegségmegelőzési és Jár\’ányiigyi Központ (ECDC) által gyártott EURM-019 kópia kontrolt használjuk. A mutációk kimutatása digitalis droplet PCR segítségével történt. A módszer során az elkészített, mintát is tartalmazó PCR reakcióelegyből olajos emulziót készítünk, a PCR reakció pedig az így keletkezett apró cseppekben játszódik le. A teljes reakció lezajlása után az emulziót egy detektorba vezetjük, ami különböző hullámhosszokon képes detektálni akár többféle PCR termék megjelenését. A vizsgálathoz a BioRad (USA) által forgalmazott, az egyes vírusvariánsok legjellegzetesebb mutációit kimutatni képes primer szetteket (az alfa variáns esetében N501Y és del69H/70V, míg a delta variáns esetében L452R) és szintén a BioRad által forgalmazott készülékeket (Automated Droplet Generator, TI00 Thermal Cycler, QX200 droplet reader) használtuk. 4. A szennyvízvizsgálatok eredményei 2020 nyarán az eredmények alacsony (méréshatár alatti) értéket mutattak, az első emelkedést a 32. héten (augusztus elején) mértük. Szeptember elején a koncentrációk jelentősen emelkedő tendenciát mutattak, október első felében azonban
