Hidrológiai Közlöny, 2015 (95. évfolyam)

2015 / 5-6. különszám - LVI. Hidrobiológus Napok előadásai

107 Az utóbél baktériumközösségében az Acinetobacter l- woffii mellett megjelent a Paracoccus yeei, melyet a bél- csatorna többi részéről nem sikerült kitenyésztenünk. A Micrococcus yunnaensis a középbélhez hasonlóan itt is képviseltette magát. A Firmicutes törzs tagjai közül pe­dig a korábban szivárványos pisztrángból is leírt Lacto- coccus garvieae-t (Ricci és mtsai. 2012) izoláltuk. A busa béltartalom mintákból származó 16S rRNS-t kódoló génszakaszok DGGE vizsgálata során nyert sávmintázatok összehasonlító elemzésének eredményét a 1. ábra mutatja be. Az egyedek egyes tápcsatorna szakaszaiból származó minták baktériumközösségeiben hasonló átlagos csíkszá­mot (E, 15; K, 15; U, 17) detektáltunk, és az egyes állatokban észlelt átlagos csíkszámok esetében sem volt jelentős különbség (1109/3, 19; 1109/5, 16; 1109/6, 12). A legerősebben festődő csíkok gélsávokban való elhelyezkedése alapján azonban határozott elkülönülést lehetett megfigyelni az egyes minták között. Ennek alapján megállapítható, hogy az egy állatból származó elő- és középbéli minták mutatták egymáshoz a legnagyobb hasonlóságot. Az utóbélből származó minták külön csoportot képeztek és jobban hasonlítottak egymáshoz, mint az ugyanabból a mintából származó E és K mintákhoz. A 1109/3 és a 1109/5 jelzésű egyedek béltartalom mintáinak baktériumközösségei mindhárom bélszakasz esetében jobban hasonlítottak egymáshoz, mint a 1109/6 jelzésű egyed béltartalom mintáihoz. 1109/6U 1109/5U 1109/3 U 1109/5K 1109/3 K 1109/3 E 1109/5 E 1109/6K 1109/6E 50 ~T 60 —1----------1-----------T 70 S0 90 Hasonlóság (%) 1 100 1. ábra. A busa béltartalom minták baktériumközösségeinek DGGE sávmintázata alapján szerkesztett UPGMA dendrogram Minta DGGE csík Filogenetikai csoport Legközelebbi rokon baktériumfai (Ezl Hasonlóság % íbn) 1109/6U 1 Cyanobacteria Planktothrix agardhii (X84811) 98,8 (420/425) 1109/6K 3 Cyanobacteria Planktothrix agardhii (X84811) 96,2 (359/373) 1109/3K 5 Cyanobacteria Planktothrix agardhii (X84811) 93,6 (354/378) 1109/5K 4 Cyanobacteria Microcystisflos-aquae (AF139327) 95,2 (357/375) 1109/3K 6 Cyanobacteria Phormidium uncinatum (EF654086) 90,9 (332/365) 1109/5K 7 Cyanobacteria Phormidium uncinatum (EF654086) 89,5 (343/383) 1109/6U 2 Gammaproteobacteria Aeromonas veronii (X60414) 98,9 (473/478) 1109/6U 8 Fusobacteria Cetobacterium somerae (AJ438155) 98,4 (444/451) 3. táblázat A busa béltartalom mintákból származó DGGE csíkok filogenetikai meghatározásának eredmenye a 16S rRNS gén vizsgálata alapján A PCR-DGGE molekuláris biológiai ujjlenyomat módszer előnye, hogy a gélből kivágott csíkokból vissza­nyert DNS szakaszok bázissorrendjének elemzésével a mintákban jelenlévő domináns szervezetekről taxonómiai-filogenetikai információ nyerhető. A kivágott csíkokból származó átlagosan 400 bázispár hosszúságú DNS szakaszok 90-99 %-os hasonlóságot mutattak már ismert és tenyésztésbe vont baktériumfajokkal. A mintákban megjelent domináns csíkok között legnagyobb arányban a Cyanobacterium törzsbe tartozó baktériumokat azonosítottunk (3. táblázat). Közülük az 1 -es és 3-as jelzésű csík előfordulása valamennyi mintában megfigyelhető volt, míg az 5-ös és 6-os csík megjelenése a 3E, 3K, és az 5E, 5K mintákra volt jellemző. A 4-es és 7-es csík ugyanakkor az 5E-, és 5K mintákra volt a legjellemzőbb. A 2-es csíkból származó DNS-t a tenyésztéssel is kimutatott Aeromonas veronii fajhoz tartozónak határoztuk meg, mely a 6E és 6K minták kivételével minden mintában jelen volt. A 8-as csíkból származó D- NS-t Cetobacterium somerae fajhoz tartozónak azonosí­tottuk, mely vizsgálataink során mindhárom busa minta utóbél szakaszában dominánsként fordult elő. Ezt a Gram-negatív, mikroaerotoleráns kemoorganotróf a- nyagcseréjű szervezetet korábban is kimutatták egyes é- desvízi halak tápcsatornájából (Fmegold és mtsai, 2003; Tsuchiya és mtsai, 2008). Összefoglalás A balatoni busák tápcsatornájának mikrobiológiai vizsgálata fajban gazdag baktériumközösségek jelenlétére mutatott rá. A vizsgált busa egyedek béltraktusa számos aerob és fakultatív anaerob, fakultatív patogén, de enzimtermelése révén akár pozitív

Next

/
Thumbnails
Contents