Hidrológiai Közlöny, 2014 (94. évfolyam)

2014 / 4. szám - László Kristóf - Jáger Katalin - Krett Gergely - Boros Gergely - Specziár András - Borsodi Andrea: Adatok a Balatonban élő busa fajok béltartalmának baktériumközösségeiről

36 HIDROLÓGIAI KÖZLÖNY 2014 94. ÉVF. 4. SZ. mintázatok összehasonlító elemzésének eredményét a 1. ábra mutatja be. Az egyedek egyes tápcsatorna szakaszaiból származó minták baktériumközösségeiben hasonló átlagos csíkszá­mot (E, 15; K, 15; U, 17) detektáltunk, s az egyes álla­tokban észlelt átlagos csíkszámok esetében sem volt je­lentős különbség (1109/3, 19; 1109/5, 16; 1109/6, 12). A legerősebben festődő csíkok gélsávokban való elhelyez­kedése alapján határozott elkülönülést lehetett megfi­gyelni az egyes minták között. Ennek alapján megállapít­ható, hogy az egy állatból származó elő- és középbéli minták mutatták egymáshoz a legnagyobb hasonlóságot. Az utóbélből származó minták külön csoportot képez­tek és jobban hasonlítottak egymáshoz, mint az ugyan­abból a mintából származó E és K mintákhoz. A 1109/3 és a 1109/5 jelzésű egyedek béltartalom mintáinak bak­tériumközösségei mindhárom bélszakasz esetében job­ban hasonlítottak egymáshoz, mint a 1109/6 jelzésű egyed béltartalom mintáihoz. 1109/6U C —r—“i....n 11 no/si i raKBBHBBB*5 1109/3 U i :im:..r i 1109/5K Í :,i.....i 1 1109/3 K C .........ilJIl.] 1109/3E 1 i ^ i 1 ~j 1109/5 E I .......L-. 11 1 i 1109/6K i ...».at i 1109/6 H 1 ~~~1S55Mon i 50 T 60 “T I T 70 80 90 Hasonlóság (%) 1 100 1. ábra A busa béltartalom minták baktériumközösségeinek DGGE sávmintázata alapján szerkesztett UPGMA dendrogram Minta--— DGGE esik Filogenetikai csonort Legközelebbi rokon baktériumfai (Ezl Hasonlóság % (bo) 1109/6U 1 Cyanobacteria Planktothrix agardhii (X84811) 98.8 (420/425) 1109/6K 3 Cyanobacteria Planktothrix agardhii (X84811) 96,2 (359/373) 1109/3K 5 Cyanobacteria Planktothrix agardhii (X84811) 93,6 (354/378) 1109/5K 4 Cyanobacteria Microcystisfios-aquae (AF139327) 95,2 (357/375) 1109/3K 6 Cyanobacteria Phormidium uncinatum (EF654086) 90,9 (332/365) 1109/5K 7 Cyanobacteria Phormidium uncinatum (EF654086) 89,5 (343/383) 1109/6U 2 Gammaproteobacteria Aeromonas veronii (X60414) 98,9 (473/478) 1109/6U 8 Fusobacteria Cetobacterium somerae (AJ438155) 98,4(444/451) 3. tablazat A busa béltartalom mintákból származó DGGE csíkok filogenetikai meghatározásának eredménye a 16S rRNS gén vizsgálata alapján A PCR-DGGE molekuláris biológiai ujjlenyomat módszer előnye, hogy a gélből kivágott csíkokból vissza­nyert DNS szakaszok bázissorrendjének elemzésével a mintákban jelenlévő domináns szervezetekről taxonómi­ai-filogenetikai információ nyerhető. A kivágott csíkokból származó átlagosan 400 bázispár hosszúságú DNS szakaszok 90-99 %-os hasonlóságot mutattak már ismert és tenyésztésbe vont baktériumfa­jokkal. A mintákban megjelent domináns csíkok között legnagyobb arányban a Cyanobacterium törzsbe tartozó baktériumokat azonosítottunk (3. táblázat). Közülük az 1-es és 3-as jelzésű csík előfordulása valamennyi mintá­ban megfigyelhető volt, míg az 5-ös és 6-os csík megje­lenése a 3E, 3K, és az 5E, 5K mintákra volt jellemző. A 4-es és 7-es csík ugyanakkor az 5E-, és 5K mintákra volt a legjellemzőbb. A 2-es csíkból származó DNS-t a te­nyésztéssel is kimutatott Aeromonas veronii fajhoz tarto­zónak határoztuk meg, mely a 6E és 6K minták kivételé­vel minden mintában jelen volt. A 8-as csíkból származó DNS-t Cetobacterium somerae fajhoz tartozónak azono­sítottuk, mely vizsgálataink során mindhárom busa minta utóbél szakaszában dominánsként fordult elő. Ezt a Gram-negatív, mikroaerotoleráns kemoorganotróf anya- gcseréjű szervezetet korábban is kimutatták egyes édes­vízi halak tápcsatornájából (Fmegold és mtsai, 2003;Tsuchiva és mtsai, 2008). Összefoglalás A balatoni busák tápcsatornájának mikrobiológiai viz­sgálata fajban gazdag baktériumközösségek jelenlétére mutatott rá. A vizsgált busa egyedek béltraktusa számos aerob és fakultatív anaerob, fakultatív patogén, de en­zimtermelése révén akár pozitív hatást is kifejteni képes baktériumfaj képviselőjének ad otthont. Köszönetnyilvánítás Jelen kutatást az OTKA K83893 számú pályázat tá­mogatásával végeztük. Irodalom Altschul, S. F„ Madden, T. L., Schaffer, A. A., Zhang, J., Zhang, Z., Miller, IV., Lipman, D. J. (1997j Gapped BLAST and PSI- BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Research. 1 ;25( 17) 3389-3402. Bansemir, A., Just, N., Michalik, M., Lindequist. U.. Lalk, M. (2004) Extracts and sesquiterpene derivatives from the Red Alga Lauren- cia chondrioides with antibacterial activity against fish and human pathogenic bacteria. Chemical Biodiversity. 1, 463-467.

Next

/
Thumbnails
Contents