Hidrológiai Közlöny 2011 (91. évfolyam)

6. szám - LII. Hidrobiológus Napok: „Alkalmazott hidrobiológia” Tihany, 2010. október 6-8.

71 • nem azonosított • Cymbella • Coreidae • Actinocyclus s Chromadoridae B Corixidae in 7. ábra. Az eukarióta közösségek azonosított tagjai Következtetések A fenti eredmények alapján elmondható, hogy a molekuláris ujjlenyomat technikák alkalmasak lehetnek mikrobaközösségek összehasonlító diverzitás-vizsgálatára. Az eredmények értékelése során azonban figyelembe kell venni a módszer korlátait (választott génszakasz variabilitása, kópiaszáma, DNS visszanyerés problematikája stb.), ezért önmagában alkalmazva nem helyettesítheti a klasszikus mikroszkópos technikákat, ugyanakkor a két módszer együttes használatával pontosabb képet kaphatunk a közösségek diverzitásáról. Köszönetnyilvánítás A munka az OTKA-NKTH CNK-80140 sz. pályázat támogatásával készült. Irodalom Aguilera, A., Gómez, F., Lospitao, E., Amils, R. (2006): A molecular approach to the characterization of the eukaryotic communities o fan extreme acidic environment: Methods for DNA extraction and denaturing gradient gel electrophoresis analysis. - System. Appl. Microbiol. 29: 593-605. Altschul, S.F., TL. Madden, A.A. Schäffer, J. Zhang, Z. Zhang, W. Miller. D.J. Lipman (1997): Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. - Nucleic Acid Res. 25: 3389-3402. Amann, R. I., L. Krumholz, and D. A. Stahl. (1990): Fluorescent-oligonucleotide probing of whole cells for determinative, phylogenetic, and environmental studies in microbiology. J. Bacteriol. 172: 762Bolla, B„ Borics, G., Kiss, K. T., Reskóné Nagy. M„ Várbíró, G., Acs, E. (2010): Recommendations for ecological status assessment of Lake Balaton (largest shallow lake of Central Europe), based on benthic diatom communities. - Accepted paper Vie et Milieu. Dorigo, U., Leboulanger, C., Bérard, A., Bouchez, A., Humbert, J. F., Montuelle, B. (2007): Lotic biofilm community structure and pesticide tolerance along a contamination gradient in a vineyard area. Aquat. Microb. Ecol. 50: 91-102. Felföldi. T. (2010): Fotoautotróf pikoplankton közösségek diverzitásának molekuláris biológiai vizsgálata és a populációk szezonális dinamikájának felmérése. Doktori értekezés, Bpest, ELTE pp. 149. Jackson, C. R., Churchill, P. F., Roden, E. E. (2001): Successional Changes in Bacterial Assemblage Structure during Epilithic Biofilm Development. - Ecology 82(2): 555-566. Lane, D. J. (1991): 16S/23S rRNA sequencing. - In E. Stackebrandt and M. Goodfellow (ed.), Nucleic Acid Technology in Bacterial Systematics. John Wiley and Sons, New York, 115-175. Marchesi, J. R., T. Sato, A. J. Weightman, T. A. Martin, J. C. Fry, S. J. Hiom, D. Dymock, and W. G. Wade. (1998): Design and evaluation of useful bacterium-specific PCR primers that amplify genes coding for bacterial 16S rRNA. - Appl. Environ. Microbiol. 64: 795-799. Muyzer, G. (1999): DGGE/TGGE, a method for identifying genes from natural ecosystems. - Curr. Opin. Microbiol. 2: 317-322. Szabó K.É., Makk J., Kiss K.T., Eiler A., Ács É„ Tóth B., Kiss Á.K., Bertilsson S. (2008): Sequential colonization of river periphyton a nalysed by microscopy and molecular fingerprinting. - Freshwater Biol. 53(7): 1359-1371. Tamura, K, J. Dudley, M. Nei, S. Kumar (2007): MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0. Mol. Biol. Evol. 24: 1596-1599. Vörös, L. (1997): Sekély és mély tavak fotoautotróf pikoplanktonja. Dissertationes in honorem iubilantis Gabor Uherkovich. Comparison of the genetic diversity of benthic microbial communities living in two basins with different trophic levels of Lake Balaton Pohner, Zs.', Ács, É.', Borsodi, A.

2, Kiss, K. T.', Palatinszky, M.

2, Reskóné N. M.

3, Várbíró, G.

4, Mészáros, É.

2, Duleba M.', Bíró, P.

5 Abstract: To survey the ecological status of natural aquatic systems is crucial to gain as accurate information about the structure of existing microbial community as possible since its dynamics can be an indicator of water quality changes. Molecular fingerprinting methods can be effective supplements of information gained by classical microscopic techniques, in the way of giving a pattern describing the whole microbial community. As a part of a complex study denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) on the basis of 16S rDNA and 18S rDNA was used to examine the whole bacterial and eukaryotic microbial communities existing in two basins with different trophic levels of Lake Balaton (Keszthely and Siófok basins). Samples were taken from the northern and southern littoral region from reed, stone, sediment and artificial substratum, in June and August 2008. The gained relative abundance values were analyzed by principal component analysis which showed the separation of the sediment samples from the other substrata in the plane determined by the first two components in both of the sampling times. In June microbial communities of other substrata grouped mainly according to the different basins but in August this was not so characteristic. There can be found differences between the diversity of the two basins with various trophic levels. The eukaryotic microbiota of Keszthely basin and the bacterial community of Siófok basin showed higher diversity on the average. The means of each OTU number of the basins also show this difference. Keywords: microbial diversity, benthos, OTU, DGGE, Lake Balaton.